Varias acciones tendientes a consolidar e implementar las nuevas áreas silvestres protegidas,que se encuentran bajo el dominio de la Entidad Binacional Yacyretá (EBY), viene desarrollando el Programa de Reservas y Biodiversidad del Sector Medio Ambiente.

Tareas de control y vigilancia de los recursos naturales e infraestructura disponible realizan a través de patrullajes personal guarda recurso y técnico asignado en la Reserva Natural Guasu Puku y la Reserva de Recursos Manejados del Aguapey.
 

Igualmente se trabaja en el reacondicionamiento de los centros administrativos de las dos reservas, de manera que el personal, pueda cumplir con las actividades programadas en el Plan Operacional, a fin de lograr la administración y manejo efectivo de las áreas protegidas.

Otro campo de acción, es el trabajo con la población del área de influencia de estas Reservas, con los cuales se están realizando tareas de reforestación con especies de la flora autóctona, con el fin de restaurar aquellos ecosistemas que sufrieron alteraciones,  y a l la vez generar fuente de empleo para las poblaciones de la zona.