YACYRETÁ es administrada por un Consejo de Administración y un Comité Ejecutivo integrado por igual número de nacionales de ambos países.

Son órganos de administración de YACYRETÁ el Consejo de Administración y el Comité Ejecutivo.

1. El Consejo de Administración está compuesto por ocho consejeros nombrados:

a) Cuatro por el Gobierno argentino;

b) Cuatro por el Gobierno paraguayo.

2. Los dos directores integran el Consejo, deben asistir a sus reuniones, con voz pero sin voto y conjuntamente podrán convocarlos a reuniones extraordinarias.

3. El Consejo de Administración designa de su seno un presidente para presidir las reuniones y eventualmente convocarlo en ciertos casos previstos.

4. Las reuniones del Consejo son presididas, alternativamente, por un consejero de nacionalidad argentina o paraguaya y, rotativamente, por todos los miembros del Consejo.

5. El Consejo nombra dos secretarios, uno argentino y otro paraguayo, cuyas funciones son determinadas en el Reglamento Interno.